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Equipe "Biodiversité microbienne et fonctionnement des écosystèmes aquatiques"
Laboratoire Biologie des Protistes, UMR 6023 CNRS-Université Blaise Pascal (Clermont-Ferrand II)
La thématique scientifique de l’équipe est la diversité et le rôle des microorganismes dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques. Les recherches de l’équipe ont pour objectif l’étude de la diversité, à différents niveaux - infraspécifique, spécifique, fonctionnel - des réseaux trophiques microbiens en milieu aquatique. A l’aide d’une approche écosystémique dans des lacs de niveau trophique différent et d’une approche expérimentale en conditions contrôlées, nous étudions les liens trophiques existant entre les microorganismes afin de mettre en évidence la diversité des cheminements d’énergie et l’impact de l’altération de cette diversité sur la capacité de régulation des systèmes. Les travaux sont menés dans le cadre de programmes locaux (projet PREVOIR), nationaux (Microbiologie fondamentale) et internationaux.
Actuellement, les recherches sont focalisées sur les 6 points suivants :
Rôle des virus dans le fonctionnement des écosystèmes lacustres et étude de leur l’impact dans la dynamique de la biodiversité microbienne aquatique. (T Sime Ngando)
Effet des ressources et de la prédation sur la structure et la diversité des communautés bactériennes.
Rôle des microparticules organiques d’origine détritique dans la formation de microhabitats et dynamique de la diversité spécifique et fonctionnelle des communautés de bactéries et de protozoaires.
Etude des flux de matière dans les réseaux trophiques à l’aide de marqueurs organiques naturels (acides gras) et des rapports d’isotopes stables (C13, N15).
Diversité taxonomique et fonctionnelle des communautés microbiennes des zones pélagiques aérobies et anaérobies ainsi que des sédiments des écosystèmes aquatiques. Métabolismes microbiens anaérobies : oxydation anaérobie du méthane, réduction microbienne des métaux (fer, manganèse), sulfato-réduction.
Voir en ligne : site web du laboratoire Biologie des Protistes
